Questo WP è trasversale per tutto il progetto e coordina gli inputs dei partners, esegue il controllo di qualità e il project management, assicurando che il piano di lavoro concordato sia seguito e applicato dai partners del progetto. I partner inseriti nel GO permettono un costante e rilevante scambio di informazione in tutti i WP.

Questo WP è trasversale e diviso in 3 momenti: WP2a iniziale è utile per la definizione delle strategie di comunicazione e divulgazione (piano di comunicazione e sito web), WP2b in itinere per l’attuazione delle strategie di comunicazione (giornate di campagna e seminari) e il WP2c finale è utile per la disseminazione dei risultati raggiunti.

Definire le condizioni di crescita e i protocolli di campionamento della specie di interesse (pomodoro) è un prerequisito fondamentale per il successo del seguente WP.

Scopo del WP sarà lo sviluppo di un catalogo di campioni utilizzati da tutti i partners, e la definizione di un protocollo per l’analisi metagenomica e metatrascrittomica. In generale si campioneranno gli apparati radicali di 4 sottospecie di Solanum lycopersicum commercialmente rilevanti (piccadilly, ciliegino, datterino e grappolo), analizzandone il microbiota in modo da comprenderne gli effetti benefici sulla fitness dell’ospite.

Il Next-Generation Sequencing (NGS) permette la definizione di un core-microbiome e della sua caratterizzazione funzionale tramite studi di metagenomica e metatrascrittomica durante il ciclo vitale delle colture in varie condizioni. Le analisi sono eseguite tramite il portale bioinformatico integrativo (WP6), e contribuiscono alla progettazione del sistema esperto per le predizioni. Viene considerata la complessità del microhabitat associato alla pianta, quindi rizosfera e compartimento endofitico, che, per ogni pianta, sono analizzati attraverso 16s rRNA amplicon sequencing. Le analisi trascrittomiche (RNA-seq) sono eseguite contemporaneamente al sequenziamento per consentire la comprensione del meccanismo di azione del microbioma quando patterns interessanti sono rilevati.

Capire la complessa interazione tra pianta e microbi benefici, commensali e patogeni è essenziale per sfruttare pienamente le potenzialità produttive della pianta. Per capire e identificare la relazione pianta-microrganismi sono intraprese le seguenti attività: Identificazione dei geni e dei cluster genici dei microrganismi attivati nel sistema ospite-pianta attraverso analisi trascrittomiche. Il risultato principale di questo WP è la caratterizzazione della biodiversità dei batteri in connessione con l’assorbimento dei nutrienti e con la resistenza alle malattie.

Lo scopo di questo WP è la gestione e l’immagazzinamento dei dati prodotti, lo sviluppo di nuove tecniche personalizzate ai bisogni specifici delle analisi. La quantità di dati richiedere metodi avanzati, con il supporto di strutture computazionali e di Big Data innovative, per la generazione di ipotesi basate sui dati sperimentali. Il principale risultato di questo WP è lo sviluppo di tools e pipeline per l’analisi dei dati, il database/data warehouse per contenere tali dati, e un sistema di supporto decisionale per l’agricoltura di precisione.

Il WP7 prevede le seguenti fasi di sviluppo: individuazione e programmazione di azioni volte al miglioramento. Infine il WP prevede la certificazione del Disciplinare Tecnico di Produzione da parte dell’Ente di Certificazione Accreditato.

Il WP finale consiste nella validazione e certificazione del Disciplinare Tecnico di Produzione – DTP da parte dell’Ente di Certificazione Accreditato prescelto, della metodologia utilizzata, degli elementi caratterizzanti descritti all’interno del disciplinare per i singoli prodotti e nella verifica dei dati relativi oggetto di monitoraggio in un dato periodo.

La piattaforma informatica prodotta nell’ambito delle attività progettuale sarà lo strumento utile per la diversificazione dell’attività agricola: le aziende del GO forniranno, attraverso una nuova attività economica ateco, servizi di elaborazione- estrapolazione- calcolo dati e analisi, rivolti ad aziende del territorio interessate alla tematica innovativa. Inoltre l’applicazione dei principi della Smart Agriculture permette di creare nuove possibilità di lavoro sul territorio (es. tecnici per installazione e riparazione dei sensori, agronomi responsabili dei dispositivi digitali di tracciabilità, ecc.), garantendo la possibilità di sviluppo di nuove competenze e nuove occupazioni nel settore dell’informatica applicata all’agricoltura.